芝云洞位于石林之西北约5公里处，又叫紫云洞，由大、小芝云洞，大干洞、猪耳朵洞组成，总面积约2.55平方公里，它是岩溶地貌的地下奇观之一。
石林溶洞虽多，但其中游人最多，最早被人们发现的，要数芝云洞。洞距大小石林约5公里左右。康熙《澄江府志》、《路南州志》都有记载：“芝云洞，硐门石似芝与云，故名。芝云初入，磅礴空敞，可容千人；再入葫芦口内更宽广。四壁乳窟,击之有钟鼓声。又有石枰、石床、石田、石浪,奇怪不可名状。古号仙迹。”
溶洞虽然号称“仙踪”，但凡人亦可进入寻迹。带着汽灯、手电进入洞内，迂回蛇行，不久，即见一厅豁然开朗，石钟乳、石笋、石柱玲珑剔透，斗奇争胜。再往前走，洞口狭窄，仅能通入，不一会，又有一个宏敞的大厅呈现在人们的面前。厅内怪石奇峰，各呈奇观。
更妙的是这些石钟乳击之有声，有的清脆悦耳，有的洪亮悠远，有的雄浑辽阔，妥加利用，说不定还会成为一个奇妙的音乐呢！大厅左右还有许多小洞，高低宽窄，各有特点，洞套洞，似断实连，丰富，奇巧，令人叫绝。通过大厅再往前进，洞逐渐窄小，忽有一穴透光，如矩形窗户。至则为洞口，遥望群山，一片葱绿，倍加可爱，阳光了分外明媚。
小芝云洞，在大芝云洞北侧。洞门极狭，仅能容一人。稍进即阔，凉气宜人。水湿苔滑，道路难行，游人较少。洞内石菌、石花、石山俯拾即是。
芝云洞与杭州的“烟霞三洞”、桂林的七星岩相比，景色之奇丽有过之而无不及。
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